Veľká Fatra patří mezi nejrozsáhlejší a nejtypičtější pohoří Slovenska, kde se zachovalo mnohotvárné a málo narušené přírodní prostředí. Reliéf Veľké Fatry je značně členitý s velkým výškovým rozpětím. Tento výškový gradient ji řadí mezi vysoké hornatiny Slovenska. Mezi vzácná rostlinná společenství patří zbytky reliktních borů na vápencových skalách.
Na území Veľké Fatry převažují horské druhy živočichů. Dosud v ní bylo zjištěno kolem 110 druhů hnízdících ptáků a 60 druhů savců. Ze šelem možno uvést medvěda, rysa a vlka. Hnízdí zde orel skalní.
Z důvodu ochrany přírody byl na území Veľké Fatry vyhlášen národní park. Veľká Fatra spolu s přilehlými kotlinami překypuje bohatstvím podzemních vod, z nichž mnohé prameny se i využívají
